Не скажу, что особо разбираюсь именно в разных способах, поэтому не смогу рассказать про лучший. Советую посмотреть на других сайтах, там все подробнее описано, и иногда даже довольно понятно. Но все таки кое-что напишу по этому вопросу.

Чтобы вывести WebMoney в любом случае понадобится статус не ниже формального. Для этого нужно отправить системе отсканированные - паспорт, ИНН, банковскую карту (если будете на нее выводить).

Выводить всегда проще - WMR. Поэтому, если у Вас WMZ, WME или еще что-то советую поменять на WMR. Это можно сделать через разные on-line обменники, (только выбирайте надежный, читайте отзывы на WebMoney Advisor) или с помощью встроенной в сам Keeper функции обмена. Выгоднее всего это сделать через обменный сервис, который принадлежит webmoney - wm.exchanger.ru. Находите там наверху "работать в секции" и выбираете "текущие WM-WM". Далее появится таблица вверху которой раскрывающийся список - что хотите получить и что отдать. Если, например меняете свои WMZ на WMR надо выбрать "хочу WMR отдам WMZ". В таблице находятся предложения на покупку Ваших WMZ. Достаточно много предложений по курсу выше чем у ЦБ и можно даже немного заработать на обмене, что конечно не лишне, учитывая комиссию системы за обмен 0,8%. Еще один плюс в том, что можно обменять часть суммы, например, пишут, что есть 30000 WMR - нужно 947 WMZ, можете обменять по этому предложению 100 WMZ  т.е. не на всю сумму.

Вывести WMR можно:

- Через обменный пункт. Это старый проверенный способ (лично я пока делаю именно так), находите обменный пункт (удобно это делать в сервисе geo.webmoney.ru), который поближе, и где комиссия поменьше. Обычно комиссия от 2 до 5%. Далее туда хорошо бы позвонить, убедится, что  пункт существует :) и оговорить сумму. Переводите на указанный кошелек эту сумму и приходите к ним с паспортом. Там Вам выдадут наличные.

Вот несколько способов, которые мне понравились, надо будет попробовать как-нибудь:

- Вывести WMR на банковский счет. В системе webmoney написано, что они "предлагают возможность вывести WMR на рублевый счет ЛЮБОГО российского банка". Для этого нужно открыть счет. При переводе работает посредник (Гарантийное Агентство), так что деньги должны зачислится от него. Выбираем Вывести WM - Перевод WMR на указанный банковский счет. Далее заполняем реквизиты (получить в банке распечатку) и нажать - Согласовать. После согласования нужно выбрать созданный шаблон платежного поручения, ввести сумму и нажать - Оплатить. Потом придет счет, который нужно будет оплатить. Через пару дней можно идти в банк и снимать деньги со счета. И еще.. некоторые пишут, что комиссии никакой кроме 0,8% webmoney, но банк за зачисление средств все таки может взять комиссию (это надо уточнять в банке), к тому же содержание счета стоит денег (см. тарифы банка).

- Вывести WMR на банковскую карту. Этот способ похож на предыдущий, просто вводятся данные карточного счета. Вывести WM - Перевод WMR на указанный банковский счет, заполняем реквизиты, жмем - Найти вводим номер карточного счета, затем вписываем название шаблона вводим сумму, жмем Согласовать, приходит счет, оплачиваем, подтверждаем и все. Через пару дней деньги поступят и их можно будет снять с карты. Ну и все то же самое, что в предыдущем варианте - за зачисление могут взять комиссию и за обслуживание карты надо платить. Некоторые выбирают вывод на специальные карты, которые можно привязать к системе (там вывод моментальный). Многие хвалят Альфа банк. Я не думаю, что буду через него делать когда либо, так как комиссия в этом случае 0,8% webmoney + 2% Альфа банк, лучше уж "Открытие" или "Океан Банк", там берут 1% + конечно 0,8% webmoney. См. тут типы выпускаемых карт и тарифы.

Если очень надо, то на банковский или карточный счет можно вывести и WMZ привязав их к webmoney. Карта может быть и рублевая, в этом случае доллары будут конвертированы (курс мне неизвестен). Комиссия при зачислении на карту 0,6%, но не менее 8$. Подробнее о выводе WMZ на карту здесь. Сервис для вывода WMZ на банковский счет.

- Денежный перевод. WebMoney сотрудничают с несколькими системами денежных переводов и предлагают пользователям возможность выводить WMR через них. Тут выбор зависит от комиссии каждой из систем помимо. Самые зверские условия у Contact 1,5%, но не менее 60руб. Самые адекватные Anelik и Золотая Корона - 1,5%. Если сюда добавить 0,8% WebMoney, то получается общая комиссия 2,3%. Смотрите сами в этом сервисе.

Пара интересных способов, о которых почему-то редко пишут:

И оба осуществляются на сервисе wm.exchanger.ru, о котором уже шла речь. Там помимо того, что можно менять WM деньги одного типа на другой, есть и другие интересные возможности.
- sdp.exchanger.ru - можно выбрать справа в вверху. Этот сервис позволяет выводить WMR в наличные (и наоборот) с помощью платежных систем (NELIK, CONTACT, WESTERN UNION, UNISTREAM). Обмен идет меджу двумя участниками системы и сервис выступает гарантом сделки. Подробно как это работает можно прочитать здесь http://cash.exchanger.ru/sdp/pages/rules.aspx. А если говорить простым языком, то - Вы хотите поменять WMR на рубли, а есть где-то человек, который хочет поменять рубли на WMR и вы находите друг друга на этом сервисе с помощью заявок, которые можно увидеть в таблице. Например, выбираете направление RUR=>WMR и видите, заявку, где написано, что есть 158 RUR, нужно 158 WMR, способ обмена - платежная система CONTACT. Если устраивает такой курс, кликаете на поставленную заявку, заходите в свой кошелек и подтверждаете, что согласны на условия обмена. Вы в данном случае получатель и сообщаете фамилию, имя, город проживания и другие реквизиты требуемые системой денежных переводов, через которую будет осуществляется перевод. Далее система отправит Вам и второму участнику, который покупает WMR уведомления о начале обмена. Второй участник идет и переводит через платежную систему CONTACT по указанным Вами данным сумму 158 рублей, а система списывает с Вашего кошелька 158 WMR на свой. После получения денег Вы сообщаете системе, что все в порядке и 158 WMR выводятся на счет второго участника. В момент начала операции с каждого из участников списывают страховой взнос. Его возвращают после совершения сделки. Если сделка не состоялась, то страховой взнос перечисляют в пользу пострадавшей стороны. Большой плюс этого способа то, что можно найти выгодный курс обмена, а если ничего не подошло выставить заявку на своих условиях. Также можно выводить WMZ и WME. Перевод по платежной системе осуществляет физ. лицо и это не облагается никакими налогами, если в назначении платежа не писать, что этот перевод за оказанные услуги и т.п. (не должно фигурировать получение выгоды какой либо из сторон). С получателя наличных RUR удерживается только комиссия системы 0,8%.

- wire.exchanger.ru - ссылка также находится справа вверху. То же самое, что предыдущий вариант. Разница в том, что деньги перечисляются не через платежную систему, а с банковского счета на банковский счет, поэтому вместо ФИО, города  т.д. нужно будет указывать банковские реквизиты. Преимущества те же (перевод от физ лица  физ. лицу), но банк может взять комиссию за зачисление (см. условия банка).